Quando Shougo se suicidou, uma Ninja Soul se apossou de seu corpo para trazê-lo de volta à vida e o transformou em um ninja! Isso não passou batido pela Soukaiya e Shougo foi forçado a trabalhar para a Yakuza. Mas sua primeira missão o colocará em conflito com a única pessoa por quem nutre algum sentimento! Em meio a isso, o Ninja Slayer continua à espreita para acabar com todos os ninjas!